Dahulu, wilayah Desa Pandanwangi masih berupa rawa-rawa dan sebagian hutan. Seiring waktu, kawasan ini berkembang menjadi pemukiman dan lahan pertanian.

Nama Pandanwangi berasal dari tanaman pandan yang subur di daaerah ini, terutama di kawasan sumber air yang sekarang masuk wilayah Dusun Krajan II. Pandan dikenal sebagai tanaman berdaun hijau dengan bunga berbau harum, sehingga desa ini diberi nama Pandanwangi (Pandan yang Wangi)

Sebelum tahun 1986, Desa Pandanwangi masih menjadi satu dengan Desa Pandanarum. Namun, karena kebutuhan wilayah, akhirnya desa tersebut dipecah menjadi 2 saat masa kepemimpinan Kepala Desa Achmad Khoiri.

• Desa Pandanwangi: bagian timur (60% wilayah)

• Desa Pandanarum: bagian barat (40% wilayah)

1. Mewujudkan keamanan di Desa yang  berkesinambungan

2. Reformasi birokrasi yang efektif, profesional, akuntable dan transparan untuk mewujudkan pemerintah desa yang baik, benar dan bersih yang berbasis teknologi

3. Pemenuhan kebutuhan dasar untuk mewujudkan masyarakat yang lebih sejahtera dan mandiri