BUMDesa Jaya Sentosa merupakan badan usaha milik desa yang mengelola berbagai unit usaha berbasis potensi lokal, seperti jasa penyewaan peralatan, GOR, dan pengembangan produk UMKM. Lembaga ini bertujuan untuk meningkatkan pendapatan asli desa sekaligus membuka lapangan kerja bagi warga.
Karang Taruna Jaya Wangi adalah organisasi kepemudaan yang aktif dalam kegiatan sosial, budaya, olahraga, serta pelatihan keterampilan. Organisasi ini menjadi wadah bagi generasi muda untuk berkarya, membangun solidaritas, dan berkontribusi terhadap pembangunan desa secara kreatif dan produktif.
Lembaga Pemberdayaan Masyarakat Desa (LPMD) bertugas membantu pemerintah desa dalam menyusun perencanaan pembangunan, serta mendorong keterlibatan aktif masyarakat dalam berbagai program pemberdayaan. LPMD juga menjadi penghubung antara aspirasi warga dan arah kebijakan pembangunan desa.
Koperasi Merah Putih Desa Pandanwangi berperan sebagai lembaga ekonomi kerakyatan yang melayani kegiatan simpan pinjam, distribusi kebutuhan pokok, dan usaha kolektif lainnya. Koperasi ini menjadi sarana penguatan ekonomi warga melalui semangat kebersamaan dan kemandirian.
Kelompok Informasi Masyarakat (KIM) Desa Pandanwangi berperan dalam menyebarluaskan informasi desa, termasuk kebijakan, program, dan potensi lokal, kepada masyarakat. KIM juga berfungsi sebagai sarana edukasi digital dan komunikasi dua arah antara pemerintah desa dan warga.
PKK Desa Pandanwangi aktif dalam memberdayakan keluarga melalui program-program yang berfokus pada kesehatan, pendidikan anak, pengelolaan ekonomi rumah tangga, serta pelestarian lingkungan. PKK juga mendukung peran perempuan dalam pembangunan desa yang berkelanjutan.
RT dan RW adalah lembaga kemasyarakatan yang bertugas mengkoordinasi kegiatan warga di tingkat lingkungan serta menjembatani komunikasi antara warga dengan pemerintah desa.